MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 plasmid pSHJGH2

Total Repeats: 1720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020293	CG	3	6	35	40	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
2	NC_020293	ACC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866852
3	NC_020293	GCC	2	6	93	98	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
4	NC_020293	TGC	2	6	173	178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
5	NC_020293	GC	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
6	NC_020293	CCCGC	2	10	275	284	0 %	0 %	20 %	80 %	457866852
7	NC_020293	GGAACC	2	12	291	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
8	NC_020293	TCC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
9	NC_020293	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
10	NC_020293	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
11	NC_020293	CG	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
12	NC_020293	GGC	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
13	NC_020293	GGC	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
14	NC_020293	CGG	2	6	411	416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
15	NC_020293	GTG	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
16	NC_020293	CTC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
17	NC_020293	GCG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
18	NC_020293	GGT	2	6	455	460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
19	NC_020293	TCG	3	9	514	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
20	NC_020293	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
21	NC_020293	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
22	NC_020293	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
23	NC_020293	CCG	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
24	NC_020293	ACC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866852
25	NC_020293	GCC	2	6	648	653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866852
26	NC_020293	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	457866852
27	NC_020293	GGC	2	6	714	719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
28	NC_020293	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
29	NC_020293	GTCC	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	457866852
30	NC_020293	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
31	NC_020293	CG	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
32	NC_020293	CTCGG	2	10	946	955	0 %	20 %	40 %	40 %	457866852
33	NC_020293	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
34	NC_020293	TGG	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866852
35	NC_020293	TGA	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	457866852
36	NC_020293	GTCG	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	457866852
37	NC_020293	TCG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866852
38	NC_020293	GCG	3	9	1064	1072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
39	NC_020293	CGG	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
40	NC_020293	ACG	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
41	NC_020293	GCA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866852
42	NC_020293	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	457866852
43	NC_020293	GCGG	2	8	1264	1271	0 %	0 %	75 %	25 %	457866852
44	NC_020293	CGG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866852
45	NC_020293	GGCC	2	8	1285	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	457866852
46	NC_020293	CCT	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
47	NC_020293	CCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866852
48	NC_020293	GAG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866852
49	NC_020293	GCT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866853
50	NC_020293	CCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866853
51	NC_020293	CCT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866853
52	NC_020293	CGCC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	25 %	75 %	457866853
53	NC_020293	GAC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866853
54	NC_020293	GGC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866853
55	NC_020293	CCGG	3	12	3149	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	457866853
56	NC_020293	CGG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866853
57	NC_020293	CGT	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866853
58	NC_020293	GCA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866853
59	NC_020293	TCCT	2	8	3307	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	457866853
60	NC_020293	ACCCGC	2	12	3375	3386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	457866854
61	NC_020293	CGGC	2	8	3477	3484	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
62	NC_020293	TG	3	6	3502	3507	0 %	50 %	50 %	0 %	457866854
63	NC_020293	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
64	NC_020293	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	457866854
65	NC_020293	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	457866854
66	NC_020293	CTG	3	9	3710	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
67	NC_020293	CG	3	6	3752	3757	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
68	NC_020293	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
69	NC_020293	TTC	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	457866854
70	NC_020293	CCT	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
71	NC_020293	CGCC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	25 %	75 %	457866854
72	NC_020293	GCCGC	2	10	3808	3817	0 %	0 %	40 %	60 %	457866854
73	NC_020293	TCC	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
74	NC_020293	CCG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
75	NC_020293	CCT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
76	NC_020293	CCA	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866854
77	NC_020293	CGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
78	NC_020293	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
79	NC_020293	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	457866854
80	NC_020293	TCCAC	2	10	4033	4042	20 %	20 %	0 %	60 %	457866854
81	NC_020293	CCGG	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
82	NC_020293	CGG	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866854
83	NC_020293	CACTC	2	10	4117	4126	20 %	20 %	0 %	60 %	457866854
84	NC_020293	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	457866854
85	NC_020293	ACCC	2	8	4172	4179	25 %	0 %	0 %	75 %	457866854
86	NC_020293	GCGG	2	8	4241	4248	0 %	0 %	75 %	25 %	457866854
87	NC_020293	TCC	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866854
88	NC_020293	GCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
89	NC_020293	CAG	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
90	NC_020293	ACG	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866854
91	NC_020293	GGT	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866854
92	NC_020293	CCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
93	NC_020293	GTC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866854
94	NC_020293	GCC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866854
95	NC_020293	CAGT	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	457866854
96	NC_020293	GGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866855
97	NC_020293	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	457866855
98	NC_020293	GC	3	6	5210	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	457866855
99	NC_020293	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866855
100	NC_020293	ATC	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	457866855
101	NC_020293	CCGG	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
102	NC_020293	GCT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866856
103	NC_020293	CAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866856
104	NC_020293	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866856
105	NC_020293	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866856
106	NC_020293	GCG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866856
107	NC_020293	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866856
108	NC_020293	CAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866856
109	NC_020293	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
110	NC_020293	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
111	NC_020293	GGGCA	2	10	6351	6360	20 %	0 %	60 %	20 %	457866856
112	NC_020293	CGGC	2	8	6362	6369	0 %	0 %	50 %	50 %	457866856
113	NC_020293	GCC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866856
114	NC_020293	GCC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866856
115	NC_020293	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866856
116	NC_020293	CCG	2	6	6486	6491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866856
117	NC_020293	TTC	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	457866856
118	NC_020293	CCG	3	9	6544	6552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866856
119	NC_020293	GGA	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866856
120	NC_020293	TGC	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866856
121	NC_020293	GAG	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866856
122	NC_020293	CAG	3	9	6741	6749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866856
123	NC_020293	GTAA	2	8	6811	6818	50 %	25 %	25 %	0 %	457866856
124	NC_020293	CCGGG	2	10	7226	7235	0 %	0 %	60 %	40 %	457866857
125	NC_020293	GCG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866857
126	NC_020293	TGC	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	457866857
127	NC_020293	GC	3	6	7274	7279	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
128	NC_020293	CCG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	457866857
129	NC_020293	TCC	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866857
130	NC_020293	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866857
131	NC_020293	GGC	2	6	7438	7443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866857
132	NC_020293	GCCG	2	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
133	NC_020293	AGG	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	457866857
134	NC_020293	CAG	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	457866857
135	NC_020293	CAC	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	457866857
136	NC_020293	GC	3	6	7596	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	457866857
137	NC_020293	TGG	3	9	7603	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866857
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262	NC_020293	TCTGT	2	10	12908	12917	0 %	60 %	20 %	20 %	457866863
263	NC_020293	CG	4	8	13069	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	457866863
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392	NC_020293	GCG	2	6	20187	20192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866870
393	NC_020293	GCG	2	6	20208	20213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	457866870
394	NC_020293	GTG	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	457866870
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399	NC_020293	TCC	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	457866870
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